labrep

labrep provee funciones para la generación automática del informe de circulación viral.

Instalación

Puedes decargar la versión de desarrollo de labrep desde GitHub con el siguiente comando:

# install.packages("pak")
pak::pak("TRACE-LAC/labrep")

Reporte automatizado

Actualmente, labrep provee una plantilla de reporte llamada Informe de circulación viral {labrep}, la cual recibe los siguientes parámetros de entrada: la base de datos de la Fundación Cardio Infantil, la base de datos de Otros Virus, la base de datos de Tosferina, la base de datos historica de los períodos epidemiológicos y la semana epidemiológica.

Para hacer uso de la plantilla del reporte puedes seguir los siguientes pasos:

🎥 ¿Cómo generar un reporte con labrep?

Para generar el reporte en formato PDF debes instalar LateX. Puedes instalarlo siguiendo las instrucciones que se encuentran en R Markdown Cookbook.

Si estas realizando la instalación en computador oficial o de alguna institución, te recomendamos seguir los siguientes pasos para evitar inconvenientes con el suso e instalación de LateX:

1. Solicitar permisos con la mesa de soporte de la institución para instalar LateX y los siguientes paquetes:

• fontenc
• inputenc
• babel-spanish
• floatrow
• fancyhdr
• graphicx
• hyperref
• pdfpages
• xcolor
• colortbl
• caption
• montserrat
• array

Errores comunes

Si tienes problemas generando el reporte o en la etapa de rendirización del reporte se queda cargando infinitamente, ejecuta los siguientes pasos:

1. En RStudio dirigite al tab de Terminal y ejecuta los siguientes comandos:

tlmgr option repository https://mirror.ctan.org/systems/texlive/tlnet
tlmgr update --self
tlmgr install fontenc inputenc babel-spanish floatrow fancyhdr graphicx hyperref pdfpages montserrat xcolor colortbl caption array

Desarrollo

Ciclo de vida

Este paquete actualmente está en la fase de concepto, como lo define RECON software lifecycle.

Contribuciones

La contribuciones son bienvenidas vía pull requests.